摘要:目的运用分子对接技术模拟预测TCMSP数据库中药成分对新型冠状病*(SARS-CoV-2)3CL水解酶的作用。方法基于SARS-CoV-23CL水解酶的PDB晶型结构(6LU7),构建虚拟靶标模型,以TCMSP数据库中的个化合物为配体筛选对象,以6LU7原配体分子为对照,采用薛定谔软件,以Glide程序建立6LU7分子对接体系。然后以原配体分子的对接打分结果为阈值,口服生物利用度(OB)≥30%或类药性(DL)≥0.18为标准筛选候选化合物。最后建立“成分-药材-归经-功效”网络,对候选成分的主要药材归属和作用功效进行总结。结果按照对接打分、OB、DL筛选标准,共筛选得到化合物60个。受体-配体相互作用结果显示,候选化合物主要与靶点蛋白的GLU、GLY、ASP、CYS、GLN和LEU等发生氢键作用。网络预测结果显示,所筛选化合物主要归属药材为甘草、桑白皮、满山红、虎杖和车前草等,肺脏是作用的关键靶器官,其作用功效以清热解*、止咳祛痰、泻肺平喘等功效为主。结论对TCMSP数据库化合物进行虚拟分子对接得到的结果为SARS-CoV-23CL水解酶抑制剂筛选提供了相关数据。
年12月开始,一种不明原因的急性肺炎在中国武汉爆发,该病是由新型冠状病*(SARS-CoV-2)感染所致的一种急性肺部传染病,已从武汉迅速向中国其他城市扩散。由于该次疫情传播的严重性,世界卫生组织(WHO)已于年1月30日将此处疫情宣布为“国际